Son cours est long de 240 km et s'écoule globalement du sud vers le nord à travers le territoire de Bafwasende dans la province de Tshopo. La rivière Loya prend sa source à l'intérieur du parc national de la Maïko, au pied des monts Tai et Maganda, à près de 1000 m d'altitude. Elle marque d'est en ouest sur près de 80 km, une partie de la frontière nord du parc national de la Maïko avant de reprendre la direction nord jusqu'à son embouchure dans la rivière Lindi au nord-est de la localité d'Opienge.

La Loya est donc un sous affluent du fleuve Congo dans le bassin versant du Lualaba en RD Congo.

 

Principaux affluents de la rivière Loya:

 

• Loya Occidental
• Angumu
• Esmopio
• Lenge Lenge
• Lulu
• Bilola
• Bola
• Dolume
• Mayegekoni