La rivière Bomu prend sa source à proximité du tripoint formant la frontière entre la République démocratique du Congo, le Soudan du Sud et la République centrafricaine, à une altitude supérieure à 700 mètres.Tout au long de son cours, elle constitue une frontière naturelle entre la RD Congo et la République centrafricaine. Son tracé, orienté globalement d’est en ouest, s’étend sur environ 1 055 km (selon les données OpenStreetMap), ce qui en fait le neuvième plus long cours d’eau de la RDC.
La plupart des localités situées sur ses rives se trouvent du côté centrafricain, notamment Zémio et Bangassou, qui restent toutefois de taille modeste. Du côté congolais, le bassin de la Bomu est peu densément peuplé et comprend plusieurs zones naturelles protégées, dont la réserve de Bomu (est et ouest).
Parmi ses principaux affluents figurent la rivière Chinko en République centrafricaine et la rivière Bili en République démocratique du Congo.
La Bomu donne également son nom aux préfectures de Haut-Bomu et de Bomu en République centrafricaine. Elle rejoint finalement la rivière Uele près de la localité de Yakoma, pour former la rivière Ubangi.
Principaux affluents de la rivière Bomu en RD Congo:
- Bili (573 km)
- Rengu (155 km)
- Asa (130 km)
- Dume (110 km)
- Bangaro (76,6 km)
- Buye (54,8 km)
- Gangia (53,7 km)
- Kabanda (42 km)
- Balinga (37 km)
- Kangu (35,9 km)
- Anda (35,8 km)
- Vungu (34,8 km)
- Aza (34,3 km)
- Tanga (34,1 km)
- Kuegu (33 km)
- Nguli (32 km)
- Balume (29 km)
- Bakanga (27,4 km)
- Lalo (27,6 km)
- Mabaga (22,8 km)